Desde os primeiros anos do século vinte, os cristãos no Japão e na América do Norte oraram pelo estabelecimento de uma universidade cristã no Japão. Seu sonho há muito acalentado finalmente se concretizou após o fim da Segunda Guerra Mundial. Refletindo sobre a catástrofe da guerra, e com forte sentimento de responsabilidade para com as gerações futuras, foi fundado um comitê encarregado da missão de implantar a UTI.
A decisão oficial de estabelecer a Universidade Cristã Internacional foi tomada pelo Conselho de Organização da Universidade. Esses líderes da igreja cristã no Japão e na América do Norte realizaram uma reunião no YMCA Tozanso em Gotemba, província de Shizuoka, em 15 de junho de 1949. A primeira página foi assim escrita na história da UTI, nutrida pelos desejos e orações daqueles que buscavam para transformar o Japão em um país aberto ao mundo que busca criar indivíduos que possam contribuir ativamente para um futuro pacífico para a humanidade.